Целью программы аспирантуры является подготовка аспирантом диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук в области информационной безопасности. Аспирантам предлагается участие в научно-исследовательских работах по созданию методов защиты информационных систем от внутренних и внешних угроз, математических моделей и методов криптографических доказательств, обладающих свойством нулевого разглашения, по разработке стойких криптографических протоколов.