Реализация образовательных программ магистратуры осуществляется в рамках выбранного направления подготовки в учебных корпусах, лабораториях и научных центрах унивесритета и партнерах-работодателей. Магистранты в рамках учебного плана изучают как общеобразовательные дисциплины, так и профессиональные дисциплины по профилю направления, формируемые с учетом требований предприятий заказчиков. Магистранты имеют возможность формировать свой учебный план, через построение индивидуальной образовательной троектории обучения. С первых дней обучения вовлекаются в научно-исследовательские проекты.
Фундаментальное направление подготовки физиков для работы в сфере высоких технологий и наноиндустрии. Выпускники специальности — ученые-теоретики — работают в научно-исследовательских организациях. Их основная задача — изучение физических явлений, проведение практических экспериментов, анализ и обобщение полученных данных.